La bodega de Txakoli Amunategi se ubica en el edificio construido para este fin el año 1849. Se realizaron obras de restauración, manteniendo la tipología esencial del edificio, para albergar en su interior una bodega moderna.

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Las instalaciones de la bodega actual se han diseñado para albergar únicamente el txakoli de los propios viñedos que lo rodean. La bodega está dotada de la más moderna tecnología para la elaboración de Txakoli blanco. Tiene una capacidad de elaboración de 27.500 litros, repartidos en 4 depósitos de 5000 litros y tres de 2.500 litros.

Manteniendo la misma estructura de bodega, se ha evolucionado hacia modernas instalaciones de acero inoxidable con sistemas automáticos de control de temperatura e inertización.